澳門公教中心地段由公教中心管理有限公司管理,並分別由「澳門公教中心(社團)」和「公教中心酒店」獨立運作。
澳門公教中心不再只是一個地標,在2021年正式成為非牟利社會服務團體,並將會繼續秉承公教中心數十年來的宗旨與服務精神,以新時代的步伐與方式,服務澳門社區;同時回應澳門文遺旅遊之都的地位,為旅客提供更多有關天主教世遺與文化等資訊。
澳門公教中心(社團)將執行地下至四樓及十七樓的運作,包括管理展覽廳、綜合禮堂、各活動室與會議室等的租賃服務等。同時,期望未來能發展多項惠及社會的計劃,真正成為澳門小城的橋樑。
公教中心酒店與澳門公教中心分開運作。朝聖者及旅客如需了解酒店服務,請另行查詢。